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Présentation d'INRAE
INRAE, Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement, est un organisme public de recherche rassemblant une communauté de 12 000 personnes, réparties dans 272 unités de recherche, de service et d'expérimentation implantées sur 18 centres sur toute la France.
Institut de recherche finalisée, il est le premier organisme de recherche mondial spécialisé sur l'ensemble « agriculture-alimentation-environnement ». INRAE a pour ambition d'être un acteur clé des transitions nécessaires pour répondre aux grands enjeux mondiaux.
Face à l'augmentation de la population et au défi de la sécurité alimentaire, au dérèglement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, l'institut a un rôle majeur pour construire des solutions et accompagner la nécessaire accélération des transitions agricoles, alimentaires et environnementales. Environnement de travail, missions et activités
Vous rejoindrez l'UMR 1225 Interactions Hôtes-Agents Pathogènes (IHAP), une structure multidisciplinaire de recherche en infectiologie animale, rattachée au département de Santé Animale d'INRAE. Située sur le campus de l'ENVT, son principal objectif est de comprendre les interactions entre les microorganismes pathogènes et leurs hôtes, aux différentes échelles du vivant (molécule, cellule, individu, population).
Les recherches menées à IHAP portent sur : (i) la biologie des agents pathogènes connus ou émergents, zoonotiques ou enzootiques responsables de maladies infectieuses chez les animaux d'élevage et/ou chez l'humain ; (ii) la réponse de l'hôte et les processus pathologiques ; (iii) les facteurs épidémiologiques qui impactent la dynamique et le contrôle des maladies infectieuses chez les animaux d'élevage.
L'équipe d'accueil, intitulée « Virus : Emergences, interactions et évolution » (VIRéMIE), étudie les interactions entre les virus et leurs hôtes. Les recherches de l'équipe s'inscrivent dans le concept « One Health » et s'articulent autour de 3 axes thématiques :
(i) Evolution, plasticité et émergence des pathogènes ;
(ii) Compréhension des mécanismes régulant les processus infectieux et de la réponse de l'hôte ;
(iii) Amélioration du contrôle et de la maîtrise des maladies infectieuses.
Nos sujets d'étude sont les virus influenza enzootiques ou émergents responsables d'infections respiratoires chez les volailles et les ruminants. Depuis leur émergence en Europe, les virus influenza hautement pathogènes (HPAIV) H5N1 de clade 2.3.4.4b ont eu une étendue géographique de plus en plus importante, un spectre d'hôtes croissant, des passages aux mammifères de plus en plus fréquents, une évolution vers l'enzootie, et ont été associés à un changement dans la gestion en Europe avec la mise en place de la vaccination en France à l'automne 2023.
Dans ce contexte en constante mutation, votre objectif sera d'étudier les mécanismes et conséquences de l'évolution des virus influenza aviaires. Vous vous concentrerez sur des questions de recherche portant sur les mécanismes évolutifs qui déterminent l'émergence de variants viraux favorisant le franchissement des barrières d'espèce, ainsi que sur l'impact de la vaccination sur l'évolution virale.
L'équipe VIRéMIE a déjà mis en place des modèles (in vitro, ex vivo, in vivo) et des outils (systèmes de génétique inverse, de minireplicon, séquençage haut-débit et analyses bioinformatiques, etc) dans ses installations de confinement biologique (BSL2-3 et animalerie A2-A3). Vous serez amené à développer des modèles expérimentaux d'évolution sous différentes pressions de sélection, à analyser-interpréter des données de séquences (sélection de variants, populations intra-hôte, etc.), à évaluer les conséquences des évolutions observées sur la transmission inter-espèces (potentiel zoonotique) ou sur la protection vaccinale.
Vous bénéficierez du très large réseau collaboratif de l'équipe, incluant le réseau de recherche national sur les virus influenza GDR'Resaflu' et des réseaux et programmes de recherche européens et internationaux sur les virus influenza. Afin de mettre en place votre thématique de recherche, vous bénéficierez dans un premier temps du support financier de projets financés et vous serez accompagné pour la recherche de financements.
Une expérience en expérimentation animale et au travail en milieu confiné sont souhaitées.
De plus, le poste de chargé de recherche nécessitera de travailler en zone à régime restreint (ZRR), soumise à autorisation d'accès.
Formations et compétences recherchées
Doctorat ou équivalent
Les compétences recherchées sont : compétences sur l'étude de l'évolution des agents pathogènes ; compétences / appétence pour la bioinformatique et les mathématiques.
En outre, aptitude et goût pour le travail en équipe, bonne autonomie et leadership sont recherchés.
Enfin, le ou la candidate devra être sensible aux questions éthiques et de gain de fonction.
Votre qualité de vie à INRAE
En rejoignant INRAE, vous bénéficiez :
- De 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- D'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- De dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- D'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- De prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- D'activités sportives et culturelles ;
- D'une restauration collective.
Consultez notre guide pour faciliter la venue et le séjour des scientifiques internationaux à INRAE
#LI-FG1
Modalités pour postuler
- Je télécharge le guide
Guide des candidats CRCN 2025
pdf - 3.72 MB
- Je note le numéro du profil
CR-2025-SA-1
- Je m'inscris
Inscription
Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publique notamment en ce qui concerne l'obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l'exercice de leurs fonctions, qu'elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu'elles soient religieuses, philosophiques ou politiques. > En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr
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