Post-doctorant en bioinformatique et en intelligence artificielle (h/f)

Informations générales

Intitulé de l'offre : Post-doctorant en Bioinformatique et en Intelligence Artificielle (H/F)
Référence : UMR7178-REGSOM-208
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : STRASBOURG
Date de publication : mercredi 23 octobre 2024
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 décembre 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Entre 3021,50 et 4208,37 euros bruts mensuels selon expérience
Niveau d'études souhaité : Niveau 8 - (Doctorat)
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
Section(s) CN : Organisation, expression, évolution des génomes

Missions

En étroite collaboration avec des générateurs de données et des bio informaticiens, le candidat ou la candidate développera des outils d'intelligence artificielle (IA) pour l'interprétation des données de spectrométrie de masse à grande échelle issues à la fois de l’analyse métabolomique et protéomique. Ces outils s’appliqueront, entres autres, au décodage de données MS/MS acquises sur des polymères de stockage de données.

Activités

- Adapter et, si nécessaire, redévelopper des modèles prédictifs basés sur l'apprentissage automatique et l'IA à la fois en métabolomique et protéomique
- Développer une solution performante pour l’interprétation des données MS/MS acquises sur des polymères de stockage de données
- Développer une interface web utilisable par les générateurs de données
- Participer à l’amélioration des méthodes d’acquisition des données grâce aux résultats de l’apprentissage
- Présenter ses résultats à des collaborateurs générateurs de données, biologistes ou chimistes
- Rédiger des publications et présenter ses résultats lors de conférences.

Compétences

Savoirs généraux, théoriques ou disciplinaires :
- Etre titulaire d'un doctorat dans le domaine de l’intelligence artificielle et/ou de l’apprentissage automatique

Savoir-faire opérationnels :
- Maîtriser un langage de programmation (notamment Python, des connaissances en R, Rust, C (++), ou en développement web étant des atouts importants)
- Disposer de fortes compétences en apprentissage automatique et en intelligence artificielle
- Avoir des connaissances ou une expérience dans la gestion de données -omiques (à grande échelle), en biochimie des protéines, en spectrométrie de masse ou en chromatographie seront considérées comme des atouts
- Avoir des connaissances ou un fort intérêt pour la biologie ou la biomédecine
- Disposer d’une excellente maîtrise de l'anglais écrit et oral, (de niveau B2 selon le cadre européen commun de référence pour les langues)

Contexte de travail

L’Institut Pluridisciplinaire Hubert CURIEN (IPHC), unité mixte de recherche sous cotutelle du CNRS et de l’Université de Strasbourg (UMR7178), est un laboratoire pluridisciplinaire où des équipes de recherche de cultures scientifiques différentes (écologie, physiologie et éthologie, chimie et physique subatomique) développent des programmes de très haut niveau avec pour socle l’instrumentation scientifique. L'IPHC est structuré en 4 départements et comptabilise un effectif total de 393 agents (H/F) dont 257 agents permanents (soit 119 chercheurs et enseignants-chercheurs et 138 ingénieurs et techniciens H/F), 46 agents en CDD et 102 doctorants H/F.

Le candidat ou la candidate retenu(e) rejoindra l'équipe LSMBO (Laboratoire de Spectrométrie de Masse BioOrganique) de l'IPHC, où il ou elle bénéficiera de la proximité avec les générateurs de données sur une large gamme d'instruments de pointe (LC-MS/MS), d'une expertise analytique, ainsi que de compétences en apprentissage automatique, en IA, et d'une infrastructure informatique via l'accès à des installations informatiques centralisées de pointe. Le projet sera mené en collaboration avec le groupe CompOmics de l'Université de Gand et du VIB, à Gand, en Belgique, dirigé par le Prof. Dr. Lennart Martens.


Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.

Contraintes et risques

Travail dans un environnement certifié ISO 9001

Informations complémentaires

Les candidatures doivent inclure un CV détaillé, une lettre de motivation, un résumé de la thèse de doctorat, ainsi que deux références potentielles.