Mission :
Piloter techniquement le projet de développement de l'outil REINDEER, programme de bioinformatique permettant à des non spécialistes de créer et d'interroger leurs propres index de séquences notamment sur des questions liées à la santé.
Activités :
-Piloter le projet de développement de l'outil en apportant des améliorations techniques et en ajoutant des fonctionnalités
-Collaborer avec les équipes de recherches et apporter une expertise dans l'utilisation des méthodes mathématiques et des techniques informatiques pour la modélisation et la simulation d'un phénomène physique
- Faciliter les I/O, paramétrage, documentation technique et utilisateur.
- Automatisation de tests unitaires et fonctionnels, tests de performance.
- Packaging, installation via conda ou pip. Mise en place d'intégration continue.
- Aide au déploiement d'index dans les équipes partenaires.
- Développement d'une API REST afin de faciliter l'interfaçage avec l'outil, notamment pour l'interrogation d'index via des interfaces web.
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