Ingénieur-e développement en microscopie d'expansion (h/f)

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Ingénieur-e développement en microscopie d'expansion (H/F)

Date Limite Candidature : lundi 17 mars 2025 23:59:00 heure de Paris

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Informations générales

Intitulé de l'offre : Ingénieur-e développement en microscopie d'expansion (H/F)
Référence : UAR3420-MONFER-002
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : BORDEAUX
Date de publication : lundi 24 février 2025
Type de contrat : IT en contrat CDD
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 7 avril 2025
Quotité de travail : Complet
Rémunération : entre 2847€ et 3005€ bruts mensuels selon expérience
Niveau d'études souhaité : BAC+5
Expérience souhaitée : 5 à 10 années
BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en plateforme scientifique


Missions

L'ingénieur-e devra prendre en charge l'implémentation, l'optimisation et le développement des techniques de microscopie d'expansion en collaboration avec des équipes de recherche en neuroscience.


Activités

Les activités du/de la candidat-e s’inscrivent principalement dans le cadre d’un projet collaboratif ANR, et se résument à :

1. Mise en place des protocoles de préparation des échantillons pour la microscopie d’expansion en tissu, appliqués sur des tranches organotypiques de cerveaux de souris.
2. Optimisation et développement des marquages avec des sondes fluorescentes spécifiques pour des protéines de membrane (protéines d’adhésion et récepteurs membranaires).
3. Traitement et analyse d’image (FIJI et Jupyter notebooks), reconstruction 3D des images de microscopie d’expansion avec le logiciel Imaris, développement d’une méthode de segmentation des composants biologiques.
4. Prise en charge de l’activité expansion au BIC :
* Formation des utilisateurs à toutes les étapes de la préparation d’échantillons, de l’acquisition des images et de leur analyse.
* Organisation de séminaires et d’évènements pour déployer la technique.
* Mise en place et participation à des collaborations scientifiques.
1. Rédaction de protocoles et d’articles de recherche méthodologiques.


Compétences

- Maîtrise en biochimie de la protéine et connaissances en neurobiologie
- Solides connaissances en microscopie de fluorescence
- Expertise en traitement et analyse d'image et reconstruction 3D
- Participation à des projets de recherche
- Solides compétences en organisation et communication
- Rigueur, motivation et capacité d'interaction avec les collègues et les collaborateurs
- Curiosité intellectuelle, goût pour la technologie et l'innovation
- Anglais niveau C1-C2


Contexte de travail

Le Bordeaux Imaging Center (BIC, UMS 3420) est la plus grande plateforme de microscopie d'Aquitaine. Le Pôle photonique du BIC fournit des prestations et des formations sur plus de 20 microscopes optiques à une large communauté de chercheurs du domaine biomédical public et privé. L'activité de développement de microscopie photonique du BIC se consacre à l'implémentation et à la conception de techniques d'imagerie de pointe, donnant accès aux technologies les plus avancées. La préparation d'échantillons biologiques pour l'imagerie photonique devient une des spécialités de notre plateforme. Les échantillons biologiques sont observés à des échelles allant du centimètre pour l'imagerie d'organes entiers au nanomètre pour le suivi de molécules uniques. Le-la candidat-e sera sous la responsabilité directe d'une ingénieure de recherche CNRS en charge du développement méthodologique sur le pôle de microscopie photonique du BIC et travaillera en proche collaboration avec les huit autres ingénieurs du pôle photonique.

#J-18808-Ljbffr