Laboratoire
Nous recherchons un(e) bioinformaticien(ne) motivé(e) et productif(ve) pour rejoindre notre équipe Replication Program and Genome Instability ( Équipe Chen ) à l' Institut Curie, Paris, France. Notre équipe utilise des approches génomiques de pointe à haut débit et des analyses de données à l'échelle du génome pour étudier le programme de réplication spatio-temporel du génome humain.
Nos recherches visent à comprendre comment le stress réplicatif affecte la stabilité du génome, à la fois dans des cellules normales et cancéreuses. Grâce à des méthodologies innovantes, nous analysons ces processus à différentes échelles, allant des études sur des populations à des analyses au niveau de la molécule ou de la cellule unique.
Cette opportunité unique vous permettra de contribuer à une recherche de pointe en génomique et bioinformatique, au sein d'une institution de renommée mondiale située au cœur de Paris. Rejoignez-nous pour explorer comment la réplication et la stabilité du génome influencent les fonctions cellulaires et les maladies.
Projet de recherche
Le/la candidat(e) (M/F) retenu rejoindra notre effort interdisciplinaire visant à élucider les mécanismes qui préservent la stabilité du génome lors de la réplication et de la réparation de l'ADN. Les cassures double-brin (DSBs) et le stress réplicatif représentent des menaces majeures pour l'intégrité du génome, associées à des maladies telles que le cancer et les troubles neurologiques. Nos projets intègrent des technologies de pointe, incluant l'imagerie et le séquençage à haut débit de molécules uniques, ainsi que la modélisation computationnelle et la bio-informatique, pour étudier ces processus avec une résolution sans précédent. L'interaction entre la réplication et la réparation de l'ADN est cruciale pour maintenir l'intégrité du génome. Emerson et al. (2022, Nature) ont mis en évidence comment les fourches de réplication peuvent se bloquer et s'effondrer en cassures double-brin, nécessitant une réparation par recombinaison homologue (HR), tandis que Li et al. (2023, Cell) ont décrit comment le stress réplicatif déclenche des cascades de signalisation spécifiques pour protéger la stabilité du génome. Nos projets intégrés visent à cartographier comment le stress réplicatif induit les voies de réparation et comment leur dérégulation contribue à la progression des maladies.
Le projet ANR « SMART » se concentre sur la recombinaison homologue (HR), une voie clé pour la réparation des cassures double-brin, en explorant sa régulation et son interaction avec la structure de la chromatine et l'organisation spatiale du génome. Parallèlement, le projet « Impulscience » étudie les programmes de réplication de l'ADN, leur adaptation au cours du développement et leur dérégulation dans des conditions pathologiques comme le cancer et la neurogenèse. En s'appuyant sur des technologies innovantes et des collaborations avec des experts de renommée internationale, nous visons à élucider comment le stress réplicatif et la réparation de l'ADN interagissent pour maintenir la stabilité du génome.
En combinant les connaissances issues de ces études phares avec des approches à haut débit novatrices, nos projets permettront de mieux comprendre comment les mécanismes de réplication et de réparation coordonnent la préservation de la stabilité du génome. Cet effort interdisciplinaire devrait fournir des perspectives révolutionnaires sur les bases moléculaires des maladies telles que le cancer et les troubles neurodégénératifs. Rejoignez notre équipe pour contribuer à une recherche transformative à l'interface de la biologie moléculaire, de la génomique et de la bio-informatique, et ouvrir la voie à de nouvelles découvertes sur la maintenance du génome et son rôle dans les maladies humaines.
Bibliographique Références
1. Arnould, C., Nature, 590, 660-665 (2021).
2. Wang, W., Mol. Cell, 81, 2975-2988.e6 (2021)
3. Promonet, A., Nat. Commun. 11:3940 (2020)
4. Gnan, S., Nat. Commun., 13, 2329 (2022)
5. Vernekar, DV., Nucleic Acids. Res., 49, 4522-4533. (2021)
6. Emerson, Nature. 606:812–819 (2022)
7. Li, J., Cell, 186:98-111.e21 (2023)
8. Liu, Y., et al. Nucleic Acids. Res., gkac1239 (2023
Spécificités du poste
- Déplacements occasionnels : pour assister à des réunions de projet, des ateliers ou des conférences avec des collaborateurs.
- Position assise prolongée : Des aménagements ergonomiques peuvent être mis en place pour réduire l'inconfort.…
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