Ingénieur en bioinformatique f/h (h/f)

RESPONSABILITÉS :

Vous recherchez des missions passionnantes et innovantes qui ont du sens et vous souhaitez vivre une expérience professionnelle avec de vrais challenges ?
Alors rejoignez l'Université de Franche-Comté, acteur majeur de la formation, recherche et de l'innovation.
Au sein de l'Université de Franche-Comté Santé, l'ingénieur biologiste en traitement de données H/F est en charge de la recherche sur la plateforme Bio-informatique et Big data au Service de la Santé (2B2S).
Mission 1 : Développement et montage de projets en lien avec les biologistes
- Développement de nouveaux outils et pipelines d'analyses de données de NGS répondant aux besoins des équipes partenaires
- Participation au montage des projets biologiques (notamment sur les besoins en données et les techniques nécessaires)
Mission 2 : Administration système
- Administration d'un serveur de calcul sous linux (Mise à jour, gestion des droits, suivi du stockage)
- Webmaster du site web de la plateforme.
Mission 3 : Traitement des données de NGS en biologie médicale
- Analyse de données de NGS en biologie (traitements des données brutes, stockage, alignement, assemblage)
- Analyse des microbiotes humains et environnementaux
- Analyse des données de RNAseq, de ChIP-Seq
- Analyse de données de protéomique
- Appel de variants chez les procaryotes et les eucaryotes (bactéries, parasites, champignons, virus, cellules cancéreuses)
- Association des données biologiques et des données patients.
Compétences nécessaires:
- Maîtrise de plusieurs outils de programmation
- Maîtrise de l'anglais
- Solides notions en biologie
- Connaissance en administration linux
- Connaissance en analyse statistique
L'ingénieur biologiste H/F sera en contact régulier avec différents interlocuteurs:
- Directeur de la plateforme
- Autres ingénieurs du comité technique
- Comité de pilotage scientifique - directeur(rice)s des équipes partenaires
- Equipe informatique de l'UFR Santé
- Stagiaires de la plateforme
L'ingénieur biologiste H/F pourra être amené à encadrer 2 stagiaires maximum durant l'année.

PROFIL RECHERCHÉ :

Compétences nécessaires:
- Maîtrise de plusieurs outils de programmation
- Maîtrise de l'anglais
- Solides notions en biologie
- Connaissance en administration linux
- Connaissance en analyse statistique
Qualités requises:
- Autonomie
- Travail en groupe
- Forte capacité d'initiative
- Curiosité
- Sens de l'organisation
- Sens de la communication

Experience: Débutant accepté

Qualification: Cadre

L'université de Franche-Comté est une université pluridisciplinaire qui accueille chaque année près de 27 000 apprenants sur six sites : Besançon, Belfort, Montbéliard, Vesoul, Dole et Lons-le-Saunier.
Avec ses 19 unités de recherche, dont 7 UMR, 5 structures fédératives et ses 27 plateformes technologiques, l'université de Franche-Comté place au cœur de sa stratégie l'articulation formation-recherche-innovation.